El Complejo Minero Fabril San Rafael de la CNEA comenzó a funcionar en 1976 y hasta fines de los 90 se abocó a la extracción y procesamiento de mineral de uranio, primer eslabón del ciclo de combustible nuclear del país.
 
La provincia de Mendoza fue el primer sitio donde se extrajo uranio en la Argentina con los descubrimientos de las minas Soberanía, Huemul y Cerro Mirano en las décadas del 50 y 60. 

En 1951 se realizó el hallazgo del primer yacimiento uranífero denominado Papagayo, mientras que en 1952 se encontró Huemul (Malargüe) que operó hasta 1985 y que se encuentra en proceso de remediación.

Durante el funcionamiento del Complejo Minero Fabril San Rafael se extrajeron 1.600 toneladas de uranio, que representa el 20% de las reservas del yacimiento. En 1990, como consecuencia de los muy bajos precios en el mercado internacional y los elevados costos internos, el complejo detuvo su producción y dejó muchos residuos cercanos al río Diamante y sus efluentes.

En 2005, tras las denuncias de la Multisectorial de San Rafael -integrada por más de 40 entidades e instituciones- por presuntas irregularidades, se consiguió una medida cautelar que impidió su reactivación hasta tanto no se realice la remediación total de los residuos contaminantes allí depositados.